温度是影响微生物活性和堆肥工艺过程的重要因素。堆肥过程中微生物由于分解有机物而释放出热量，促使堆肥温度快速上升。当堆肥温度在55℃条件下保持3d以上（或50℃以上保持5-7d)，是杀灭堆肥所含致病微生物和害虫卵，保证堆肥卫生指标合格和堆肥腐熟的重要条件。当堆肥温度稳定在30-40℃时，说明发酵已基本完成。如下图所示，在不同翻堆次数条件下，温度在堆肥过程中的变化趋势基本一致，先后经历了升温期、高温期和降温期3个阶段。在升温阶段，以3d翻1次的堆肥温度上升快，5d达到50℃以上，较6d 翻堆1次和9d翻堆1次的堆肥提前1-2d进入高温阶段（>50℃），但其高温度（70.8℃）略低于6d翻堆1次的高温度（71℃），而高于9d翻堆1次的高温度（67℃）。高温维持时间以6d翻堆1次的堆肥长，为13d，其次为9d翻堆1次和3d翻堆1次，分别为12d和11d。在降温阶段，3d翻堆1次的堆肥温度下降快，至14d后开始显著降低，18d后下降到40℃以下，较6d翻堆1次和9d翻堆1次的堆肥（22d后下降到40℃以下）提前4d发酵基本完成，这可能与3d翻堆一次的堆肥的翻堆频率频率高，散失热量多有关